TortoiseMerge 可以通过命令行参数启动，从而避免必须通过打开对话框来手动选择文件。如果您想从另一个应用程序中使用 TortoiseMerge，这也非常有用。
大多数开关需要额外的资讯，例如路径或一些其他字符串。在这些情况下，在开关后附加一个 ':'，并在其后放置字符串/路径。例如：
/base:"c:\folder\my base file.txt"
表 B.1. 可用命令行选项列表
| 命令 | 描述 |
|---|---|
| /? | 显示一个对话框，其中包含最重要的命令行开关。 |
| /help | 与 ? 相同。 |
| /base | 指定三向比较中使用的base文件。这是被比较文件的共同祖先，尽管它没有在单独的窗口中显示。对于双向比较，这是左侧文件。 |
| /basename | base 文件的名称。这将在视图标题中显示，而不是文件路径。对于三向比较，它会在视图标题的工具提示中显示。 |
| /basereflectedname | 用于 editorconfig 模板的名称。 |
| /theirs | 指定三向比较中使用的theirs文件，显示在左侧窗格中。 |
| /theirsname | theirs 文件的名称。这将在视图标题中显示，而不是文件路径。 |
| /theirsreflectedname | 用于 editorconfig 模板的名称。 |
| /mine | 指定三向比较中使用的mine文件，显示在右侧窗格中。对于双向比较，这是右侧文件。 |
| /minename | mine 文件的名称。这将在视图标题中显示，而不是文件路径。 |
| /minereflectedname | 用于 editorconfig 模板的名称。 |
| /merged |
指定比较中使用的结果merged文件。这是保存合并/冲突解决结果的文件路径。 如果未为三向比较设置此项，则 TortoiseMerge 将询问用户将结果保存在哪里。 如果未为双向比较设置此项，则 TortoiseMerge 将自动使用右侧视图中显示的文件的路径作为保存路径。 |
| /mergedname | merged 文件的名称。这将在视图标题中显示，而不是文件路径。 |
| /mergedreflectedname | 用于 editorconfig 模板的名称。 |
| /patchpath | 应将补丁应用到的路径。如果您不设置此路径，则 TortoiseMerge 将尝试自行查找路径以匹配补丁文件中的路径，但这可能需要非常长的时间。 |
| /saverequired | 如果指定，即使使用者未修改文件，也强制 TortoiseMerge 在退出前询问是否保存文件。 |
| /saverequiredonconflicts | 如果指定，如果发现冲突，即使使用者未修改文件，也强制 TortoiseMerge 在退出前询问是否保存文件。 |
| /patchoriginal | 要修补的原始文件的名称。用于视图标题。 |
| /patchpatched | 生成的已修补文件的名称。用于视图标题。 |
| /diff | 要应用于目录的补丁/差异文件的路径。 |
| /oneway | 强制 TortoiseMerge 以单向视图启动，而不是使用者在设置中指定的视图。 |
| /reversedpatch | 切换要比较的指定两个文件的左右视图。 |
| /createunifieddiff | 创建使用 /origfile:"path_to_original_file" 和 /modifiedfile:"path_to_modified_file" 指定的两个文件的统一差异文件（补丁文件）。目标路径使用 /outfile:"path_to_resulting_patchfile" 设置。如果未设置 /outfile，则会显示文件保存对话框，以便使用者可以选择保存补丁文件的位置。注意：如果设置了 /createunifieddiff，则所有其他参数都将被忽略。 |
| /line | 指定加载文件后要跳转到的行号。 |
| /readonly | 防止文件被编辑。这意味着 TortoiseMerge 的编辑功能被禁用。 |
| /nosvnresolve | 防止 TortoiseMerge 在保存文件后询问是否在 SVN 中将文件标记为已解决。 |
您也可以在命令行上提供简单的文件名，以便与其他差异程序兼容。在这种简化形式中，命令行是：
TortoiseMerge BaseFilePath MyFilePath [ TheirFilePath ]
如果给出两个文件，它们将相互比较。如果给出三个文件，则第一个文件被视为 BASE 文件，其他两个文件将与之进行三向比较。